Chania používa jeden menší, moderne vyzerajúci terminál, ktorý je veľmi ľahko ovládateľný. Vzdialenosti k lietadlám sú krátke, v letnej sezóne očakávajte väčšie návaly ľudí na relatívne malom priestore.
Odbavenie na lety do schengenského priestoru a z neho je v spoločnej hale. Odbavenie prebieha po spoločnej bezpečnostnej kontrole, pričom niektoré brány sú po pasovej kontrole, zatiaľ čo iné nie.
Odletová a príletová hala sa nachádzajú na prízemí.
Letisko sa zatvára medzi posledným a prvým príletom, zvyčajne sú otváracie hodiny od 4:00 do 0:00.
